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Ensayo de Placa de Extensión de Unidades Formadoras de Colonias frente a Ensayo de Reacción en Cadena de la Polimerasa de Enriquecimiento en Cultivo Líquido para la Detección de Endosporas en Suelos

Autores: Griffin, Dale W.; Lisle, John T.; Feldhake, David; Silvestri, Erin E.

Idioma: Inglés

Editor: MDPI

Año: 2019

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Acceso abierto

Artículo científico


Categoría

Ciencias Naturales y Subdisciplinas

Licencia

CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual

Consultas: 3

Citaciones: Sin citaciones


Descripción
Se investigó un ensayo de reacción en cadena de la polimerasa de enriquecimiento en cultivo líquido (E-PCR) como una herramienta potencial para superar la inhibición por componentes químicos, desechos e impurezas biológicas de fondo en el suelo que estaban afectando el rendimiento del ensayo de detección para muestras de suelo que contenían subsp. (un sustituto de ). Para evaluar este ensayo, se añadieron 9 g de conjuntos emparejados de tres tipos diferentes de suelo (arena limosa [arena], limoso [limos] y arcilla) con 0, ~4.5, 45, 225, 675 y 1350 endosporas. Un conjunto emparejado se evaluó utilizando una concentración de endosporas previamente publicada y un ensayo de placa de extensión de unidades formadoras de colonias (CFU-S), y el otro conjunto emparejado se evaluó utilizando un ensayo E-PCR para investigar las diferencias en los límites de detección entre los dos ensayos. Los datos ilustraron que la detección utilizando el ensayo CFU-S en el nivel de adición de 45 endosporas comenzó a volverse esporádica, mientras que el ensayo E-PCR produjo una detección repetible en la concentración de adición de ~4.5 endosporas. El E-PCR produjo un aumento de ~2-log en sensibilidad y requirió ligeramente menos tiempo para completarse que el ensayo CFU-S. Este estudio también investigó las diferencias en la recuperación entre suelos de arena y arcilla puros y mezclados y encontró una posible activación de en suelos predominantemente basados en arcilla.

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