Desarrollo de marcadores SNP para análisis original e identificación de germoplasma en
Autores: Wang, Liubin; Xun, Hanshuo; Aktar, Shirin; Zhang, Rui; Wu, Liyun; Ni, Dejiang; Wei, Kang; Wang, Liyuan
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2022
Acceso abierto
Artículo científico
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Plantas de té
Recursos de germoplasma
Marcadores SNP
Cultivares
Análisis de relaciones genéticas
Mejoramiento
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 7
Citaciones: Sin citaciones
Las plantas de té se cultivan ampliamente en todo el mundo porque son un cultivo económico importante. La pureza y autenticidad de las variedades de té son problemas frecuentes en la conservación y promoción de recursos de germoplasma en los últimos años, lo que ha traído considerables inconvenientes e incertidumbres en la selección de líneas parentales para la cría y la investigación y cultivo de variedades superiores. Sin embargo, el desarrollo de marcadores SNP centrales puede identificar rápida y precisamente el germoplasma, lo que juega un papel importante en la identificación del germoplasma y el análisis de la relación genética de las plantas de té. En este estudio, basado en 179,970 loci SNP del genoma completo de la planta de té, se dividieron claramente los 142 cultivares en tres grupos: tipo Assam (CSA), tipo chino (CSS) y tipo transicional. La mayoría de los cultivares CSA son de la provincia de Yunnan, lo que confirma que la provincia de Yunnan es el principal centro de origen y domesticación del CSA. La mayoría de los cultivares CSS se distribuyen en el este de China; por lo tanto, dedujimos que el este de China (principalmente las provincias de Zhejiang y Fujian) es muy probablemente el área de origen y domesticación del CSS. Además, se seleccionaron 45 marcadores centrales utilizando criterios estrictos para los 179,970 loci SNP, y analizamos 117 cultivares de té bien conocidos en China con 45 marcadores SNP centrales. Los resultados fueron los siguientes: (1) En total, 117 cultivares de té fueron distinguidos por ocho marcadores, que fueron seleccionados para construir la huella genética de ADN, y los marcadores restantes se utilizaron como marcadores de reserva para la identificación del germoplasma. (2) Se confirmaron o identificaron diez pares de relaciones entre padres e hijos, y entre ellos, siete pares eran relaciones de pedigrí bien establecidas; los otros tres pares fueron recién identificados. En este estudio, el este de China (principalmente las provincias de Zhejiang y Fujian) es muy probablemente el área de origen y domesticación del CSS. Se desarrollaron los 45 marcadores SNP centrales, que proporcionan una base científica a nivel molecular para identificar el germoplasma de té superior, realizar análisis de relaciones genéticas y beneficiar el trabajo de cría posterior.
Descripción
Las plantas de té se cultivan ampliamente en todo el mundo porque son un cultivo económico importante. La pureza y autenticidad de las variedades de té son problemas frecuentes en la conservación y promoción de recursos de germoplasma en los últimos años, lo que ha traído considerables inconvenientes e incertidumbres en la selección de líneas parentales para la cría y la investigación y cultivo de variedades superiores. Sin embargo, el desarrollo de marcadores SNP centrales puede identificar rápida y precisamente el germoplasma, lo que juega un papel importante en la identificación del germoplasma y el análisis de la relación genética de las plantas de té. En este estudio, basado en 179,970 loci SNP del genoma completo de la planta de té, se dividieron claramente los 142 cultivares en tres grupos: tipo Assam (CSA), tipo chino (CSS) y tipo transicional. La mayoría de los cultivares CSA son de la provincia de Yunnan, lo que confirma que la provincia de Yunnan es el principal centro de origen y domesticación del CSA. La mayoría de los cultivares CSS se distribuyen en el este de China; por lo tanto, dedujimos que el este de China (principalmente las provincias de Zhejiang y Fujian) es muy probablemente el área de origen y domesticación del CSS. Además, se seleccionaron 45 marcadores centrales utilizando criterios estrictos para los 179,970 loci SNP, y analizamos 117 cultivares de té bien conocidos en China con 45 marcadores SNP centrales. Los resultados fueron los siguientes: (1) En total, 117 cultivares de té fueron distinguidos por ocho marcadores, que fueron seleccionados para construir la huella genética de ADN, y los marcadores restantes se utilizaron como marcadores de reserva para la identificación del germoplasma. (2) Se confirmaron o identificaron diez pares de relaciones entre padres e hijos, y entre ellos, siete pares eran relaciones de pedigrí bien establecidas; los otros tres pares fueron recién identificados. En este estudio, el este de China (principalmente las provincias de Zhejiang y Fujian) es muy probablemente el área de origen y domesticación del CSS. Se desarrollaron los 45 marcadores SNP centrales, que proporcionan una base científica a nivel molecular para identificar el germoplasma de té superior, realizar análisis de relaciones genéticas y beneficiar el trabajo de cría posterior.