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Diseñando una vacuna multi-epítopo contra mediante el empleo de proteómica de núcleo integrada, inmunoinformática y enfoques in silico

Autores: Aslam, Sidra; Ahmad, Sajjad; Noor, Fatima; Ashfaq, Usman Ali; Shahid, Farah; Rehman, Abdur; Tahir ul Qamar, Muhammad; Alatawi, Eid A.; Alshabrmi, Fahad M.; Allemailem, Khaled S.

Idioma: Inglés

Editor: MDPI

Año: 2021

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Acceso abierto

Artículo científico


Categoría

Ciencias Naturales y Subdisciplinas

Licencia

CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual

Consultas: 14

Citaciones: Sin citaciones


Descripción
, una bacteria Gram-negativa que infecta el recto, la uretra, sitios congénitos y el epitelio columnar del cuello uterino. Es una de las principales causas de ceguera prevenible, embarazo ectópico e infecciones bacterianas de transmisión sexual en todo el mundo. Actualmente no hay una vacuna multiepitopo licenciada disponible para este patógeno. Este estudio utilizó enfoques de proteómica central, inmunoinformática y proteómica sustitutiva para identificar los mejores candidatos antigénicos para el desarrollo de una vacuna basada en múltiples epítopos (MEBV). Estos enfoques resultaron en seis candidatos a vacuna: subunidad CopD2 del sistema de secreción tipo III, subunidad CopN del sistema de secreción tipo III de la familia SctW, chaperona Scc2 del sistema de secreción tipo III de la familia SycD/LcrH, efector del sistema de secreción tipo III de la familia CT847, proteína hipotética CTDEC_0668 y proteína similar a CHLPN de 76 kDa. Se utilizaron una variedad de herramientas de inmunoinformática para predecir epítopos de células B y T a partir de las proteínas candidatas a vacuna. Se desarrolló una vacuna in silico utilizando epítopos cuidadosamente seleccionados (11 CTL, 2 HTL y 10 LBL) y luego se acopló con las moléculas MHC (MHC I y MHC II) y TLR4 humano. La vacuna se acopló con el adyuvante de la subunidad B de la toxina del cólera (CTB) para potenciar la respuesta inmune. Se llevaron a cabo simulaciones de dinámica molecular (MD), acoplamiento molecular y análisis MMGBSA para analizar las interacciones moleculares y la afinidad de unión del MEBV con TLR4 y las moléculas MHC. Para lograr el nivel más alto de expresión de la proteína de la vacuna, el MEBV fue clonado y retrotraducido en . Se logró el nivel más alto de expresión y se reportó un puntaje CAI de 0.97. Se requiere una validación experimental adicional del MEBV para probar su eficacia. La vacuna desarrollada será útil para prevenir infecciones causadas por .

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