(Naviculales, Bacillariaceae) son ampliamente distribuidos, principalmente en hábitats de agua dulce, y representan 343 especies. Se describen principalmente sobre la base de características morfológicas y morfométricas. Estas características varían durante los ciclos de vida y pueden superponerse entre especies, lo que dificulta su identificación. Aislamos dos cepas de diatomeas naviculoides y las examinamos utilizando un enfoque integrador (filogenético, morfológico, datos ultrastructurales y ciclo de vida). Los análisis filogenéticos basados en datos del gen L del cloroplasto mostraron afinidad de las nuevas cepas con el género. Nuestras algas comparten características morfológicas típicas de pero difieren de especies similares en las mediciones mínimas de longitud de válvula, forma del ápice de la válvula y número mínimo de estrías en 10 m. Dos cepas son distintas entre sí en longitud y ancho máximos de válvula, forma parcial de la válvula, número de areolas en 10 m y estructura del cingulum. Se reveló que las cepas se reproducen a través de isogamia. Tres métodos de delimitación de especies (ASAP, PTP y GMYC) también confirmaron que las dos nuevas cepas estrechamente relacionadas representan especies distintas. Basándonos en datos moleculares y rasgos fenotípicos examinados dentro del marco de un enfoque integrador, describimos dos nuevos aislados como sp. nov. y sp. nov.