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Descubrimiento de proteínas putativas a partir de genomas de microalgas como una biblioteca de proteínas de biología sintética para la bio-eliminación de metales pesados

Autores: Uttarotai, Toungporn; Mukjang, Nilita; Chaisoung, Natcha; Pathom-Aree, Wasu; Pekkoh, Jeeraporn; Pumas, Chayakorn; Sattayawat, Pachara

Idioma: Inglés

Editor: MDPI

Año: 2022

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Acceso abierto

Artículo científico


Categoría

Ciencias Naturales y Subdisciplinas

Licencia

CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual

Consultas: 8

Citaciones: Sin citaciones


Descripción
La biología sintética es un principio que tiene como objetivo crear nuevos sistemas biológicos con funciones particulares o rediseñar los existentes a través de la bioingeniería. Por lo tanto, este principio se utiliza a menudo como una herramienta para poner en práctica el conocimiento adquirido en campos reales. Sin embargo, aún queda una gran cantidad de información por descubrir, lo que limita la posible utilización de la biología sintética, particularmente en el tema que es el enfoque del presente trabajo: la eliminación de metales pesados mediante biotecnología. En este trabajo, nuestro objetivo es construir una biblioteca integral de proteínas putativas que podrían apoyar la eliminación de metales pesados. Se descubrieron proteínas hipotéticas de genomas y se anotaron extensamente. Las estructuras de las proteínas de estas proteínas putativas también se modelaron a través de Alphafold2. Aunque una parte de este flujo de trabajo ya se ha demostrado para anotar proteínas hipotéticas a partir de secuencias de genomas completos, la adaptación de tales pasos aún no se ha realizado con fines de construcción de bibliotecas. También demostramos pasos posteriores que permiten una predicción de función más precisa de las proteínas hipotéticas al someter los modelos generados a una anotación basada en la estructura. En conclusión, un total de 72 proteínas putativas recién descubiertas fueron anotadas con estructuras predichas listas para usar disponibles para una investigación adicional.

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