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Dexma: un paquete de R para realizar metaanálisis de expresión génica con genes faltantes

Autores: Villatoro-García, Juan Antonio; Martorell-Marugán, Jordi; Toro-Domínguez, Daniel; Román-Montoya, Yolanda; Femia, Pedro; Carmona-Sáez, Pedro

Idioma: Inglés

Editor: MDPI

Año: 2022

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Acceso abierto

Artículo científico


Categoría

Matemáticas

Subcategoría

Matemáticas generales

Palabras clave

Metaanálisis
Transcriptómica
DExMA
Expresión génica
Software estadístico
Bioconductor

Licencia

CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual

Consultas: 30

Citaciones: Sin citaciones


Descripción
Las técnicas de metaanálisis permiten a los investigadores analizar conjuntamente diferentes estudios para determinar efectos comunes. En el campo de la transcriptómica, estos métodos han ganado popularidad en los últimos años debido al creciente número de conjuntos de datos disponibles en repositorios públicos. A pesar de esto, hay un número limitado de paquetes de software estadístico que implementan funcionalidades adecuadas de metaanálisis para este tipo de datos. Este artículo describe DExMA, un paquete de R que proporciona un conjunto de funciones para realizar metaanálisis de expresión génica, desde la descarga de datos hasta la visualización de resultados. Además, implementamos funciones para controlar el número de genes faltantes, lo cual puede ser un problema importante al comparar estudios generados con diferentes plataformas analíticas. DExMA está disponible de forma gratuita en el repositorio de Bioconductor.

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