Este estudio explora soluciones de vivienda sostenible para áreas urbanas en las Islas Galápagos, con el objetivo de equilibrar las necesidades humanas con la preservación del ecosistema fomentando la cohabitación entre las comunidades locales y las especies nativas. Reconociendo la importancia ecológica de las Galápagos y los desafíos que plantea la expansión urbana impulsada por el ser humano, la investigación se centra en Puerto Ayora como un estudio de caso. Aborda configuraciones materiales y espaciales que apoyan a especies clave como las tortugas gigantes, los iguanas terrestres y los leones marinos. Se emplean estrategias computacionales y simulaciones para guiar decisiones arquitectónicas, estructurales y de materiales, incluyendo el uso de algoritmos evolutivos y estrategias de selección basadas en métricas de rendimiento ambiental como temperatura, humedad y radiación solar. Estos algoritmos mejoran el rendimiento arquitectónico, facilitando la cohabitación entre humanos y animales, con un énfasis en la modularidad y adaptabilidad en la morfología arquitectónica. Los resultados indican que las configuraciones actuales cumplen con los requisitos de hábitat para las tortugas gigantes durante todo el año. Sin embargo, se necesitan ajustes para otras especies durante meses específicos. El estudio también destaca la biocerámica como un material novedoso para la construcción alineada con el medio ambiente en entornos restringidos. Las limitaciones incluyen el enfoque solo en especies clave, con recomendaciones para futuras investigaciones que aborden el impacto en múltiples especies e integren sistemas de desalinización y gestión de residuos para extraer el componente químico principal de la biocerámica. Este trabajo avanza en la comprensión del diseño arquitectónico de múltiples especies en regiones ecológicamente sensibles, posicionando a las Galápagos como un modelo para la cohabitación sostenible en el desarrollo enfocado en la conservación.