La raza de perro Boerboel (BBD) es indígena de Sudáfrica (SA) y desempeña un papel importante en la protección de hogares y granjas. El Departamento de Agricultura, Reforma Agraria y Desarrollo Rural (DALRRD) clasifica al BBD como una especie protegida, y se valora por su inteligencia, audacia y fuerza, así como por garantizar continuamente la seguridad de sus dueños. El objetivo de este estudio fue investigar la diversidad genética dentro de la población de BBD utilizando información de pedigrí. Los datos originales de BBD, que contenían 87,808 registros, se obtuvieron del Sistema Integrado de Registro e Información Genética (INTERGIS). Después de la edición, los datos de pedigrí incluyeron 87,755 registros de animales nacidos entre 1971 y 2019. Se realizaron análisis de pedigrí utilizando PEDIG (software Fortran 77) para determinar la completitud, los coeficientes de consanguinidad y la diversidad genética según las contribuciones genéticas de los ancestros más importantes de los animales actuales. Este estudio identificó un 91.2% de animales endogámicos en la población de BBD, con un promedio y un máximo de consanguinidad del 7.5% y el 50% de animales endogámicos, respectivamente. La tasa de consanguinidad estimada por año fue del 0.20% con un tamaño efectivo de población de 83.1. Los ancestros más influyentes explicaron el 82.63% y el 80.92% de la variación genética total para machos y hembras en las poblaciones estudiadas, respectivamente. Solo 10 ancestros importantes explicaron más del 50% de la diversidad genética de toda la población. Los números de fundadores fueron 348 y 356, y los números efectivos de fundadores fueron 57.4 y 60.1, respectivamente, para machos y hembras. Los números de fundadores fueron mayores que los números efectivos de fundadores, lo que implica una pérdida de diversidad genética debido a contribuciones desiguales de los fundadores. La población de BBD no estaba en peligro crítico según las tasas de consanguinidad y el tamaño efectivo de la población; sin embargo, la población experimentó una pérdida significativa de variabilidad genética, contribuciones genéticas desiguales por parte de los fundadores y un cuello de botella genético. Las futuras estrategias de cría podrían beneficiarse del uso de proporciones iguales de stock parental e incluir nuevas razas genéticamente distantes.