En este estudio se describe la estructura y diversidad de la comunidad de endohelmintos, así como sus interacciones con 73 especímenes de Piaractus mesopotamicus. Los peces fueron capturados en los ríos Aquidauana y Miranda, ambos ubicados en la región del Pantanal, en el estado de Mato Grosso do Sul. Se encontró un total de 608.788 especímenes de helmintos, representando cinco especies: Dadaytrema oxycephala, Chabaudinema americanum, Spectatus spectatus, Rondonia rondoni y Echinorhynchus jucundum. D. oxycephala fue la especie más prevalente (91,78%), seguida de R. rondoni (73,97%). El índice de Simpson indicó dominio en las infracomunidades de endohelmintos (C = 0,396) y D. oxycephala fue considerada la especie central. Un total de 54 hospedadores albergaron entre 2 y 3 especies de helmintos. Los pares de especies R. rondoni/D. oxycephala y S. spectatus/D. oxycephala mostraron una correlación positiva significativa entre las abundancias. Se observó una correlación positiva significativa entre la longitud total y la abundancia de S. spectatus (rs = –0,2467 y p = 0,0353). La abundancia de R. rondoni entre los períodos de 1/2003 y 2/2003 (p = 0,0356) y de 1/2003 y 4/2004 (p = 0,0009) fue significativamente diferente. Se observó una prevalencia significativa de E. jucundum en los hospedadores hembra.