Para investigar si el tamaño de las partículas fluorescentes afecta a la eficacia de modulación de la fluorescencia modulada por ultrasonidos (UMF), medimos las señales UMF y DC (corriente continua) de la emisión de fluorescencia de cuatro partículas fluorescentes de distinto tamaño: (1) tres microesferas fluorescentes (FM) modificadas con carboxilato con diámetros de 20 nm, 200 nm y 1,0 μm y (2) Alexa Fluor 647 conjugada con estreptavidina con un diámetro de aproximadamente 5 nm. Las señales UMF y DC se midieron simultáneamente utilizando un amplificador lock-in de banda ancha y un amplificador de banda estrecha, respectivamente. La relación entre la intensidad de la señal UMF y la intensidad de la señal DC se define como la eficiencia de modulación. Esta eficiencia de modulación se utilizó para evaluar los efectos del tamaño y la concentración del fluoróforo. Los resultados muestran que la eficiencia de modulación se mejoró en aproximadamente un factor de dos cuando el tamaño de las partículas fluorescentes se incrementa de 5 nm a 1 μm. Además, la relación lineal entre la fuerza de la UMF y la presión del ultrasonido (observada en nuestro estudio anterior) se mantuvo independientemente del tamaño de las partículas fluorescentes.