La expresión aberrante de genes relacionados con el cáncer puede llevar a la carcinogénesis del cáncer colorrectal (CCR), y la metilación del ADN es una de las causas de la expresión anormal. Aunque se han realizado muchos estudios para revelar cómo la metilación del ADN afecta la regulación de la transcripción, las formas en que modula la expresión génica y las regiones que afectan significativamente la regulación génica mediada por la metilación del ADN siguen siendo poco claras. En este estudio, investigamos cómo la metilación del ADN en áreas genómicas específicas puede influir en la expresión génica. Se construyeron varios modelos de regresión para la predicción de la expresión génica basada en la metilación del ADN. Entre estos modelos, se eligió ElasticNet, que tuvo el mejor rendimiento, para un análisis más detallado. La metilación cerca de los sitios de inicio de transcripción (TSS), especialmente desde 2 kb aguas arriba hasta 7 kb aguas abajo de TSS, tuvo un papel regulador esencial en la expresión génica. Además, se compilaron genes afectados por la metilación y asociados a la supervivencia, y se encontró que estaban principalmente enriquecidos en vías relacionadas con el sistema inmunológico. Este estudio investigó regiones genómicas en las que los cambios de metilación pueden afectar la expresión génica. Además, este estudio propuso que los genes expresados de manera aberrante debido a la metilación del ADN pueden llevar a la patogénesis del CCR a través del sistema inmunológico.