Se realizó una investigación durante el período lluvioso en seis estanques de producción semi-intensiva, donde el agua fluía de un estanque a otro sin ningún tratamiento. Se asignaron ocho sitios de muestreo en las salidas de los estanques durante el período lluvioso (diciembre-febrero). Los parámetros físicos y químicos del agua más bajos y más altos se registraron en el estanque P1 (un sitio cercano a los manantiales) y en el estanque P4 (un sitio crítico que recibía material alóctono de los otros estanques y también de los estanques de cultivo de ranitas), respectivamente. La disposición secuencial de los estanques provocó la concentración de nutrientes, clorofila-a y conductividad. Las lluvias estacionales aumentaron el flujo de agua en los estanques y, en consecuencia, sedimentaron más partículas y otros materiales disueltos de un estanque a otro. La sedimentación incrementó las variables limnológicas de P3 a P6. Si bien los resultados sugieren que, durante el período analizado, la lluvia afectó positivamente la calidad del agua de los estanques, y dado que los sistemas analizados se han alineado en un diseño secuencial con un flujo de agua constante desde estanques de peces y tanques paralelos sin ningún tratamiento previo, se debe tener cuidado para que un aumento en el flujo de agua inducido por la lluvia no tenga un efecto contrario en los estanques de peces investigados.