En la mayoría de las investigaciones ecológicas de campo, un muestreo adecuado es fundamental para comprender los procesos que subyacen a las poblaciones y comunidades de peces, y es aún más importante en entornos heterogéneos como los sistemas acuáticos de la región semiárida de Brasil. Este estudio pretende contribuir al desarrollo de programas de muestreo y a la selección de artes de pesca en sistemas acuáticos de la región semiárida de Brasil, evaluando los efectos de diferentes técnicas de pesca en la evaluación de la riqueza y composición de la ictiofauna en ambientes acuáticos seleccionados. Se seleccionaron seis sitios para representar entornos artificiales (embalses) y naturales (arroyos intermitentes) típicos, y se aplicaron cuatro tipos diferentes de artes de muestreo en cada sitio en cuatro ocasiones. El presente estudio demuestra que, al seleccionar técnicas de muestreo para sistemas acuáticos en la región semiárida de Brasil, se deben considerar los objetivos del estudio, por ejemplo, ecológicos o taxonómicos, para decidir sobre la inclusión de especies raras en la población de muestreo. Además, debe considerarse el efecto de los artes de muestreo sobre la abundancia natural de peces, dado que algunas técnicas de muestreo son altamente perjudiciales para las poblaciones de peces.