Con la rápida expansión de las actividades industriales, la acumulación de metales pesados en el medio ambiente se ha convertido en una amenaza seria para la seguridad ecológica y la salud pública. Los microorganismos de la rizosfera desempeñan un papel crucial en el apoyo al crecimiento y la calidad de las plantas medicinales al facilitar la absorción de nutrientes y regular el equilibrio hormonal. Sin embargo, las plantas medicinales pueden absorber metales pesados de suelos contaminados durante su crecimiento, lo que resulta en una acumulación tóxica de metales en los tejidos de las plantas y una reducción de la eficacia de los compuestos activos. Al mismo tiempo, los niveles excesivos de metales pesados suprimen el crecimiento y la actividad microbiana de la rizosfera, alteran la estructura y función de la comunidad, y debilitan sus interacciones beneficiosas con las plantas. Estos procesos conducen colectivamente a una disminución de la fertilidad del suelo, un desarrollo de las plantas obstaculizado y una seguridad y calidad comprometidas de los materiales medicinales. Esta revisión resume sistemáticamente los mecanismos por los cuales los metales pesados afectan a las plantas medicinales y su microbiota de rizosfera, y destaca que la investigación futura debería centrarse en dilucidar estas interacciones, desarrollar tecnologías avanzadas de remediación y establecer sistemas de monitoreo integrales para la calidad y seguridad de las plantas medicinales, proporcionando así una base científica para su utilización segura y mejora de calidad.