El nematodo de quiste de soja (SCN) es uno de los principales patógenos de la soja en todo el mundo. Utilizamos los datos de CHIP-Seq (secuenciación de inmunoprecipitación de cromatina) y RNA-Seq (secuenciación de ARN) de la cepa transgénica (raíces). Luego realizamos un análisis de enriquecimiento utilizando KEGG y GO para identificar posibles genes candidatos dentro de la región de unión al promotor. Se identificó una relación reguladora dirigida entre los genes utilizando el ensayo de dual-luciferasa (Luciferasa, LUC) y el ensayo de un híbrido de levadura (Y1H). Se generaron raíces peludas con sobreexpresión del gen objetivo y raíces peludas editadas genéticamente, y se evaluó su resistencia al nematodo de quiste de soja (SCN). Mientras tanto, se determinó la presencia de genes recíprocos mediante el método de cribado de biblioteca de dos híbridos de levadura. La relación de orientación entre los genes se validó aún más a través del ensayo Y1H y el ensayo LUC. Basado en evaluaciones fenotípicas de SCN, las raíces de soja transgénicas que sobreexpresan mostraron una resistencia significativamente mejorada al SCN en comparación con el tipo salvaje. Un análisis adicional reveló que colabora con otros factores regulatorios para modular la resistencia de la soja contra el SCN. El cribado de la biblioteca de dos híbridos de levadura (Y2H) identificó 18 proteínas interactivas. Estos hallazgos no solo iluminan el papel funcional de sino que también proporcionan una base para desentrañar su red molecular. Además, los resultados ofrecen prometedores genes candidatos para mejorar la resistencia al SCN y optimizar la resiliencia de la soja a través de estrategias genéticas dirigidas.