El hongo endofítico entomopatógeno puede colonizar plantas, lo que resulta en promoción del crecimiento y protección contra microorganismos fitopatógenos. Sin embargo, los cambios fisiológicos en las plantas de papa durante esta interacción son poco comprendidos. En el presente trabajo, se utilizaron cromatografía de gases-espectrometría de masas y cromatografía líquida de alta resolución para analizar las concentraciones de esteroles, ácidos grasos y ácidos fenólicos en plantas de papa inoculadas con conidios en el suelo. Mostramos un aumento en las cantidades de estigmaterol, compuestos de esteroles menores y algunos ácidos grasos hidroxilados en las hojas después del tratamiento fúngico. Además, los niveles de ácidos hidroxicinámicos, especialmente el ácido clorogénico, se elevaron en las raíces tras la inoculación. Proponemos que estos cambios podrían haber sido causados por reacciones oxidativas, y las alteraciones pueden haber resultado en efectos estimulantes del crecimiento y protectores en las plantas.