La fijación biológica de nitrógeno en la soja se ve potenciada cuando las semillas son tratadas con cobalto (Co) y molibdeno (Mo) antes de la siembra. En este estudio, nuestro objetivo fue verificar si la aplicación de Co y Mo durante la fase reproductiva del cultivo aumenta la concentración de Co y Mo en las semillas sin efectos adversos en la calidad de las mismas. Se llevaron a cabo dos experimentos. Primero, investigamos la aplicación foliar y al suelo de Co y Mo en condiciones de invernadero. A continuación, validamos los resultados obtenidos en el primer estudio. Los tratamientos para ambos experimentos consistieron en dosis de Co combinadas con Mo, y un control sin aplicación de Co y Mo. La aplicación foliar fue más eficiente en la producción de semillas enriquecidas en Co y Mo; mientras tanto, a medida que aumentaron las dosis de Co, también lo hicieron las concentraciones de Co y Mo en las semillas. No hubo efectos adversos en la nutrición, desarrollo, calidad y rendimiento de las plantas madre y las semillas cuando se aplicaron estos micronutrientes. Las semillas mostraron una mayor germinación, vigor y uniformidad para el desarrollo de plántulas de soja. Concluimos que la aplicación de 20 g ha de Co y 800 g ha de Mo a través de aplicación foliar en la etapa reproductiva de la soja aumentó la tasa de germinación y logró el mejor índice de crecimiento y vigor de las semillas enriquecidas.