La transparencia del mercado es muy demandada por los consumidores, y la autenticación de las especies es un paso importante para la trazabilidad de los productos del mar. En este estudio, se propone una estrategia molecular simple, COIBar-RFLP (código de barras de la citocromo oxidasa I-polimorfismo de longitud de fragmento de restricción), para desvelar el fraude comercial basado en la práctica de sustitución de especies en el comercio de pez espada. En particular, la codificación de COI permitió la identificación de las especies , y en las porciones etiquetadas como . Además, la digestión enzimática de los amplicones de COI utilizando la enzima de restricción I permitió la discriminación simultánea de las cuatro especies. Interesantemente, se obtuvo un patrón diferencial intraspecífico de I para las muestras de pez espada. Este patrón fue útil para diferenciar los dos clados diferentes revelados en esta especie mediante análisis filogenéticos utilizando varios marcadores moleculares. Estos resultados indican la necesidad de fortalecer las regulaciones y definir herramientas moleculares para combatir la ocurrencia de fraudes a lo largo de la cadena de suministro de productos del mar y muestran que COIBar-RFLP podría convertirse en una herramienta molecular estandarizada para evaluar la autenticidad de los productos del mar.