Los estresores ambientales, como la temperatura, son factores relevantes que podrían generar un efecto negativo en varios tejidos de los peces. Una especie clave de pez para la diversificación de la acuicultura chilena es el congrio rojo, un pez nativo para el cual el conocimiento sobre los efectos de los estresores ambientales es limitado. Este estudio evaluó los efectos del estrés por alta temperatura en el hígado del congrio rojo en grupos de control (14 grados C) y de alta temperatura (19 grados C) utilizando múltiples enfoques: determinación de enzimas hepáticas plasmáticas (ALT, AST y AP), evaluación del daño oxidativo (sitios de AP, peroxidación lipídica y proteínas carboniladas), y análisis de RNA-seq. El estrés por alta temperatura generó un aumento significativo en la actividad de las enzimas hepáticas en plasma. En el hígado, se observó una regulación transcripcional, con 1239 transcritos regulados a la baja y 1339 regulados al alza. Además, el estrés por alta temperatura generó estrés oxidativo en el hígado, con daño oxidativo y modulación transcripcional de la respuesta antioxidante. Además, se observó una respuesta a proteínas desnaturalizadas, con varias vías enriquecidas, así como una respuesta al choque térmico, con varias proteínas de choque térmico reguladas al alza, sugiriendo biomarcadores candidatos para la evaluación del estrés térmico en esta especie. El presente estudio muestra que el estrés por alta temperatura generó un efecto importante en el hígado del congrio rojo, conocimiento a considerar para la acuicultura y la pesca de esta especie.