La cepa 7 del arquetipo termoacidófilo Sulfolobus tokodaii tiene dos genes de citrato sintasa (ST1805-CS y ST0587-CS) en el genoma con un 45% de identidad de secuencia. Dado que presentan temperaturas óptimas de actividad catalítica y perfiles de inactivación térmica similares, realizamos comparaciones estructurales entre estas isozimas para dilucidar los mecanismos de adaptación a las altas temperaturas en los CSs termófilos. Las estructuras cristalinas de ST1805-CS y ST0587-CS se determinaron a resoluciones de 2,0 Å y 2,7 Å, respectivamente. La comparación estructural revela que ambas son enzimas diméricas compuestas por dos subunidades idénticas, y estas estructuras diméricas son bastante similares a las de las citrato sintasas de archaea y eubacterias. Sin embargo, ST0587-CS tiene 55 pares de iones dentro de la estructura dimérica completa, mientras que sólo tiene 36 en ST1805-CS. Aunque el número y la distribución de los pares de iones son distintos entre sí, los pares de iones intersubunitarios entre dos dominios de cada isozima son idénticos, especialmente en la región interterminal. Debido a que la localización y el número de pares de iones están en tendencia con otras CSs de microorganismos termófilos, los factores responsables de la adaptación térmica de las isozimas de la ST-CS se caracterizan por los pares de iones en la región interterminal.