La realización de hibridación distante tiene una importancia primordial para la innovación de los recursos de germoplasma de té y el cultivo de variedades de té superiores y especializadas. Sin embargo, surgen desafíos durante el proceso de cría de hibridación distante de la planta de té, con barreras reproductivas que impiden la adquisición exitosa de progenie híbrida; las etapas precisas en las que ocurren estas barreras siguen siendo inciertas. En este estudio, utilizando la cv. Jinxuan como el progenitor materno, así como Chang y la cv. Yinghong No.9 como los progenitores paternos, se llevaron a cabo hibridaciones distantes interespecíficas (DH) e intraespecíficas (IH). La investigación involucró la observación de la germinación del polen y el comportamiento del tubo polínico en el estigma, el escrutinio de la dinámica de desarrollo del ovario después de la hibridación y el examen de las etapas y razones de los trastornos reproductivos durante la hibridación distante del árbol de té. Los hallazgos indican que tanto IH como DH exhiben barreras pre-fertilización. El desarrollo pre-embrionario de los híbridos obtenidos de DH es normal, pero hay una caída significativa de frutos durante la etapa de desarrollo del fruto. La tasa de germinación de las semillas maduras obtenidas de DH es baja, y hay trastornos post-fertilización pronunciados, que son las principales razones de la dificultad para lograr una hibridación distante exitosa de la planta de té. Un análisis de la variación genética en fenotipos y componentes químicos en la progenie después de la hibridación distante reveló una variación generalizada y una rica diversidad genética. La identificación de progenie con un alto contenido de aminoácidos y cafeína ofrece promesas para la producción y cría futuras, proporcionando valiosas referencias teóricas para la selección de progenitores en la creación de recursos de germoplasma de té con bajo contenido de cafeína.