La salinidad es uno de los principales factores de estrés abiótico que limita el crecimiento de las plantas. Este estudio abordó cómo la composición y diversidad de las comunidades bacterianas asociadas a las raíces reacciona con el tiempo a las condiciones de estrés inducidas por la sal. Para comprender su adaptación a la salinización del suelo, se estudió el microbioma mediante extracción total de ADN y secuenciación, utilizando la plataforma Illumina MiSeq. Además, evaluamos los metabolitos de las plantas asociados con el estrés salino (oxilipinas, ácidos grasos (AG) y hormonas) mediante espectrometría de masas. La salinidad redujo la diversidad bacteriana en la rizosfera en plantas tratadas con sal a los 7 y 14 días, y desencadenó un cambio progresivo en la estructura bacteriana, comenzando 7 días después de imponer el estrés salino. La comunidad bacteriana de la rizosfera se enriqueció con bacterias específicas asociadas a genes potenciales involucrados en el rasgo PGP y la homeostasis iónica. Para estas plantas, los metabolitos que mostraron niveles más altos incluyeron oxilipinas de 9-lipooxigenasa (LOX), que se encontraron en los días 7 y 14. Los resultados indicaron que la salinidad parece haber inducido cambios en la comunidad bacteriana de la rizosfera, con características que pueden ayudar a la planta a responder al estrés impuesto. Además, nuestro estudio resaltó el papel de las oxilipinas de 9-LOX en la respuesta al estrés salino, brindando nuevas perspectivas sobre las complejas interacciones planta-microorganismo bajo estrés salino.