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Estrategias de decisión para lecturas de absorbancia de un ensayo inmunoenzimático de enzima vinculada: un estudio de caso sobre la prueba de genotipos de remolacha azucarera (L.) para resistencia contra (BNYVV)

Autores: Lange, Thomas M.; Wutke, Martin; Bertram, Lisa; Keunecke, Harald; Kopisch-Obuch, Friedrich; Schmitt, Armin O.

Idioma: Inglés

Editor: MDPI

Año: 2021

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Acceso abierto

Artículo científico


Categoría

Ciencias Agrícolas y Biológicas

Licencia

CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual

Consultas: 12

Citaciones: Sin citaciones


Descripción
El (BNYVV) causa la rizomanía en la remolacha azucarera (L.), que es una de las enfermedades más destructivas en la remolacha azucarera a nivel mundial. En los proyectos de cría hacia la resistencia contra BNYVV, se utiliza el ensayo de inmunoadsorción enzimática (ELISA) para determinar la concentración del virus en las raíces de las plantas y, por lo tanto, los niveles de resistencia de los genotipos. Aquí presentamos un estudio de simulación para generar 10,000 muestras pequeñas a partir de las funciones de densidad estimadas de los valores de ELISA de genotipos de remolacha azucarera susceptibles y resistentes. Aplicamos un análisis de la característica operativa del receptor (ROC) a estas muestras para optimizar los valores de corte para tamaños de muestra de dos a ocho y determinar las tasas de falsos positivos (FPR), verdaderos positivos (TPR) y el área bajo la curva (AUC). Presentamos, además, un enfoque alternativo basado en factores de Bayes para mejorar el procedimiento de decisión. El enfoque bayesiano ha demostrado ser superior al enfoque simple de corte. Los resultados presentados podrían ayudar a evaluar o mejorar los programas de cría existentes y ayudar a diseñar futuros procedimientos de selección basados en ELISA. Se proporciona un script de R para la clasificación de datos de muestra basados en factores de Bayes.

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