Los antibióticos se utilizaron extensamente en la industria de la cría de palomas anteriormente, lo que llevó a la propagación de genes de resistencia a los antibióticos (ARGs) y su deposición en los microbios intestinales, lo que se ha convertido en una importante preocupación de salud pública. En este estudio, encontramos la distinta microbiota intestinal y composiciones funcionales entre palomas jóvenes y mayores en Nanjing, provincia de Jiangsu, China, utilizando un análisis metagenómico. Streptococcus y Escherichia fueron los géneros más abundantes en palomas jóvenes y mayores, respectivamente. El análisis de ontología genética (GO) destacó el enriquecimiento significativo de componentes integrales de la membrana, unión de ATP y unión de ADN en la microbiota intestinal de las palomas. La clasificación funcional CAZy mostró que las glicosidasas, las glicosil transferasas y las esterazas de carbohidratos eran las más abundantes en los microbios intestinales de las palomas. Además, se identificaron 142 ARGs que confieren resistencia a múltiples fármacos, resistencia a la tetraciclina y resistencia a los aminoglucósidos, representando más del 70% de los resistomas fecales; el gen más abundante en palomas jóvenes fue tetraciclina-tetW, mientras que en palomas mayores fue multidrug-acrB. Adicionalmente, encontramos la mayor abundancia de genes de resistencia en palomas mayores, lo que indica un alto nivel de resistencia a los antibióticos.