El frijol adzuki ((Willd.) Ohwi & H. Ohashi) es un cultivo significativo por sus aplicaciones tanto en la medicina tradicional como en las dietas nutricionales en China. Sin embargo, sigue habiendo una escasez de exploraciones que empleen un enfoque de RNA-seq para investigar los mecanismos de respuesta molecular de la especie bajo estrés por salinidad. En este estudio, la variedad de frijol adzuki Jin Xiao Dou 6 (JXD6) fue sometida a tratamientos de 0 mmol/L (CK), 32.5 mmol/L y 65.0 mmol/L de NaCl para caracterizar preliminarmente las alteraciones inducidas por la salinidad en la altura de la planta, los contenidos de pigmentos de cloroplasto, la humedad y temperatura de la superficie de las hojas, la acumulación de HO y O, las actividades de las enzimas antioxidantes y los perfiles transcriptómicos. Bajo concentraciones crecientes de NaCl, la altura de las plántulas de JXD6 fue progresivamente inhibida. Por el contrario, las hojas unifoliadas mostraron una temperatura de superficie de hoja elevada, aumentaron los contenidos de clorofila a, clorofila total y carotenoides, así como una mayor acumulación de O, además de actividades incrementadas de superóxido dismutasa, peroxidasa y catalasa. Los análisis de perfil transcriptómico sugirieron que se obtuvieron un total de 363 y 858 genes expresados diferencialmente en las hojas unifoliadas de plántulas de frijol adzuki tratadas con grupos de 32.5 mmol/L y 65.0 mmol/L de NaCl, respectivamente. Los genes regulados al alza se enriquecieron principalmente en la vía del espliceosoma, mientras que los genes regulados a la baja se enriquecieron principalmente en vías de transducción de señales de hormonas vegetales, interacción planta-patógeno y la vía de señalización MAPK en plantas. Estos resultados proporcionan una nueva perspectiva para explorar los mecanismos de respuesta de los frijoles adzuki al estrés por salinidad a través de análisis transcriptómicos.