La temperatura reduce la viabilidad y la vigorosidad de la semilla; sin embargo, no se ha estudiado el efecto de la temperatura en la imbibición y perfil de ácidos grasos. Las semillas de chía (L.) tienen una cantidad sustancial de aceite, lo que las convierte en un modelo de estudio potencial para el metabolismo de ácidos grasos. Por lo tanto, exploramos el efecto de la temperatura (10, 20 y 30 grados Celsius) en la imbibición de semillas de chía, germinación y perfil de ácidos grasos mediante GC-MS. La imbibición FI ocurre dentro de la primera hora en todos los tratamientos; mientras que FII y FII transcurren con una diferencia de una hora a 20 grados Celsius y 30 grados Celsius. La mayor viabilidad y tasa de germinación se observaron a 30 grados Celsius; mientras que las concentraciones más altas de todos los ácidos grasos, excepto el ácido oleico, se observaron a 20 grados Celsius. Las concentraciones máximas de ácidos grasos se detectaron en FI y FII; mientras que a 30 grados Celsius, se observaron diferentes patrones para ácidos grasos saturados e insaturados y tres isómeros de ácido linolénico. Un FII más corto está asociado con una germinación más temprana; el aumento en la concentración de ácidos grasos después de 3 horas y una correlación negativa entre el ácido linoleico y linolénico observada a 20 grados Celsius se relacionaron con una mayor eficiencia de germinación. A 30 grados Celsius, la formación de isómeros está relacionada con la adaptación de la membrana celular homeoviscosa.