Pall., renombrado por su alto valor ornamental, se cultiva frecuentemente en parterres y patios, dotando a los paisajes de jardín de un atractivo único. Las flores de tonos oscuros son ampliamente consideradas como más estéticamente atractivas. Este estudio utilizó los pétalos de dos fenotipos distintos de Pall. como materiales de investigación para investigar el mecanismo subyacente de la formación del color de las flores. El Pall. de flores moradas fue designado como Grupo P, y el de flores blancas como Grupo W. Se llevó a cabo un análisis integrador completo del transcriptoma y metaboloma de los dos tipos de pétalos. El análisis metabolómico reveló que los contenidos de varios derivados de antocianina, incluyendo delphinidina, petunidina, malvidina, peonidina y procianidina, eran significativamente más altos en los pétalos morados en comparación con los pétalos blancos, siendo la delphinidina la que exhibía el contenido más alto. El análisis transcriptómico detectó 6731 genes expresados diferencialmente (DEGs) entre los tipos de pétalos blancos y morados. Específicamente, 3596 genes mostraron niveles de expresión más altos en los pétalos morados, mientras que 3135 genes exhibieron niveles de expresión más bajos en los pétalos morados en comparación con los pétalos blancos. Se identificaron diez genes de fenilalanina amoníaco-liasa (PAL), dos genes de chalcona sintasa (CHS), un gen de reductasa de antocianidina (ANR), un gen de ligasa 4-cumarato-CoA (4CL), un gen de dihidroflavonol 4-reductasa (DFR), un gen de flavanona 3-hidroxilasa (F3H) y un gen de sintasa de flavonol (FLS); todos ellos tenían pétalos morados que mostraban niveles de expresión más altos que los pétalos blancos. Esta investigación descubre el posible mecanismo de formación de antocianinas en los dos tipos de Pall., proporcionando así una base teórica para los esfuerzos de cría floral.