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Análisis a nivel genómico de las desmetilasas de ADN en plantas terrestres y su patrón de expresión en arroz

Autores: Mao, Shengxin; Xiao, Jian; Zhao, Yating; Hou, Jiaqi; Li, Lijia

Idioma: Inglés

Editor: MDPI

Año: 2024

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Acceso abierto

Artículo científico


Categoría

Ciencias Agrícolas y Biológicas

Subcategoría

Botánica

Palabras clave

Desmetilación del ADN
Procesos biológicos
Relaciones evolutivas
Plantas terrestres
Duplicación de genes
Papel fisiológico

Licencia

CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual

Consultas: 5

Citaciones: Sin citaciones


Descripción
La desmetilación del ADN es una vía bioquímica muy importante que regula un grupo de procesos biológicos, como el desarrollo embrionario, la maduración de los frutos y la respuesta al estrés. A pesar del papel esencial de las desmetilasas de ADN, su relación evolutiva y funciones biológicas detalladas en diferentes plantas terrestres siguen siendo poco claras. En este estudio, se identificaron y clasificaron 48 desmetilasas de ADN en 12 plantas terrestres. Se construyó un árbol filogenético para demostrar las relaciones evolutivas entre estas desmetilasas de ADN, indicando cómo están relacionadas entre diferentes especies. El análisis de dominios conservados, motivos de proteínas y estructura génica mostró que estas 48 desmetilasas de ADN se clasificaron en las cuatro clases de desmetilasas de ADN actualmente identificadas. La alineación de aminoácidos reveló sitios catalíticos conservados y una región de proteína menos estudiada anteriormente (denominada dominio A) dentro de las desmetilasas de ADN. Un análisis mostró un patrón conservado de duplicación génica para las desmetilasas de ADN a lo largo de su historia evolutiva, sugiriendo que estos genes se han mantenido debido a su importancia. El examen de los elementos cis del promotor mostró posibles vías de señalización y regulación de las desmetilasas de ADN. Además, se analizó el perfil de expresión para investigar el papel fisiológico de la desmetilasa de ADN de arroz en diferentes etapas de desarrollo, en tejidos y en respuesta al estrés y diversas señales de fitohormonas. Los hallazgos ofrecen una visión más profunda sobre las regiones funcionales de las desmetilasas de ADN y sus relaciones evolutivas, lo que puede guiar futuras direcciones de investigación. Comprender el papel de las desmetilasas de ADN puede llevar a una mejor resistencia al estrés en las plantas y contribuir al desarrollo de mejores variedades de cultivos y frutas.

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