Caracterización a Nivel Genómico de la Familia de Genes en y Validación Homóloga de como un Regulador Central en Redes Transcripcionales Responsivas al Estrés
Autores: Lu, Pengjun; Ji, Jianqiu; Fan, Fangjuan; Liu, Tao; Shi, Zhenting; Li, Wentao; Sun, Chongbo
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2025
Acceso abierto
Artículo científico
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Quinasas snrk
Respuesta al estrés en plantas
Gimnosperma
Producción de paclitaxel
Transcriptómica
WGCNA
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 6
Citaciones: Sin citaciones
Las quinas SnRK, reguladores centrales de la respuesta al estrés en plantas, permanecen sin caracterizar en un antiguo gimnosperma valorado por la producción de paclitaxel. Este estudio tuvo como objetivo identificar la familia y elucidar sus roles funcionales. Específicamente, identificamos genes a través de análisis genómico y evaluamos la expresión específica de tejidos mediante transcriptómica, mientras que las redes regulatorias fueron descifradas utilizando WGCNA. Para superar las limitaciones experimentales, se desarrolló un sistema de expresión transitoria de protoplastos mediado por PEG utilizando callos, seguido de ensayos de dual-luciferasa. Como resultado, se identificaron 19 genes, con expresión específica de tejidos que reveló una regulación positiva bajo metil jasmonato (MeJA) y en tejidos resistentes al estrés (corteza/raíz). Posteriormente, WGCNA descubrió un módulo específico de corteza/raíz que contenía interacciones de TF predichas. Críticamente, ensayos de dual-luciferasa homólogos demostraron la activación y los promotores (inducción de 4.34 y 3.11 veces, respectivamente). Este estudio establece la familia e identifica como un hub que integra señales de estrés (por ejemplo, MeJA) para modular redes de TF aguas abajo, mientras que el nuevo sistema de protoplastos permite futuros estudios funcionales en esta planta medicinal.
Descripción
Las quinas SnRK, reguladores centrales de la respuesta al estrés en plantas, permanecen sin caracterizar en un antiguo gimnosperma valorado por la producción de paclitaxel. Este estudio tuvo como objetivo identificar la familia y elucidar sus roles funcionales. Específicamente, identificamos genes a través de análisis genómico y evaluamos la expresión específica de tejidos mediante transcriptómica, mientras que las redes regulatorias fueron descifradas utilizando WGCNA. Para superar las limitaciones experimentales, se desarrolló un sistema de expresión transitoria de protoplastos mediado por PEG utilizando callos, seguido de ensayos de dual-luciferasa. Como resultado, se identificaron 19 genes, con expresión específica de tejidos que reveló una regulación positiva bajo metil jasmonato (MeJA) y en tejidos resistentes al estrés (corteza/raíz). Posteriormente, WGCNA descubrió un módulo específico de corteza/raíz que contenía interacciones de TF predichas. Críticamente, ensayos de dual-luciferasa homólogos demostraron la activación y los promotores (inducción de 4.34 y 3.11 veces, respectivamente). Este estudio establece la familia e identifica como un hub que integra señales de estrés (por ejemplo, MeJA) para modular redes de TF aguas abajo, mientras que el nuevo sistema de protoplastos permite futuros estudios funcionales en esta planta medicinal.