El maíz (L.) depende en gran medida de insumos de nitrógeno y fósforo, que generalmente se suministran a través de fertilizantes orgánicos e inorgánicos. Sin embargo, el uso excesivo de agroquímicos amenaza la fertilidad del suelo y la salud ambiental. Alternativas sostenibles, como el estiércol de aves de corral (PM) y las rizobacterias promotoras del crecimiento de las plantas (PGPR), ofrecen soluciones prometedoras. Este estudio examina los efectos de una formulación bacteriana fitobiótica (PHY), compuesta de y sp., aplicada sola y en combinación con PM, en el bacteriobioma de la rizosfera del maíz a través de etapas clave de crecimiento. Los ensayos de campo incluyeron cuatro tratamientos: un control, semillas recubiertas con PHY, PM y la combinación PHY_PM. Los resultados muestran que al principio del desarrollo, las rizosferas tratadas con PM aumentaron la abundancia de géneros beneficiosos como , , y , aunque los niveles disminuyeron en etapas posteriores. Las raíces tratadas con PHY_PM en la fase de plántula mostraron una abundancia reducida de taxones como , , , , y , pero este efecto no persistió. En las raíces tratadas con PM, se enriqueció significativamente en la cosecha. En general, las bacterias beneficiosas mejoraron la uniformidad microbiana, y el tratamiento PHY_PM promovió la diversidad bacteriana y el crecimiento del maíz. Un análisis genómico de las cepas PHY reveló rasgos beneficiosos para las plantas, incluyendo movilización de nutrientes, resiliencia al estrés y potencial de biocontrol. Este estudio destaca la complementariedad de PM y PGPR, mostrando cómo su integración remodela el bacteriobioma y se correlaciona con parámetros de las plantas en la agricultura sostenible.