Para el (Roxb.) B.L.Burtt & A.W.Hill, un árbol económico significativo de la familia Anacardiaceae con valor industrial, medicinal y ecológico, el tamaño del genoma sigue sin reportarse. Aquí, optimizamos el método basado en citometría de flujo para el análisis de ploidía, encontrando que la solución de lisis WPB resultó ser la más efectiva. El análisis de 58 accesiones identificó 47 diploides y 11 triploides. El tamaño promedio del genoma de los diploides se estimó en 450.36 Mb. La secuenciación Illumina de un diploide (No.22) generó 81.98 Gb de datos de alta calidad (224.44X de profundidad). El análisis de K-mer estimó el tamaño del genoma en 365.25 Mb, con un 0.91% de heterocigosidad del genoma, un 34.17% de contenido de GC y un 47.74% de secuencias repetidas, lo que indica altos niveles de heterocigosidad y duplicación en el genoma. La ensamblaje del genoma puede requerir una combinación de tecnologías de secuenciación de segunda y tercera generación. El análisis comparativo con la base de datos NT reveló que mostró la mayor similitud con (3.01%) y (2.5%). Este estudio establece un marco teórico crucial para la secuenciación del genoma y la genética molecular.