La toxicidad del aluminio (Al) es una limitación clave para el crecimiento de las plantas en suelos ácidos. Para contrarrestar el estrés por Al, las plantas secretan ácidos orgánicos como el malato desde sus raíces para quelar el Al, un proceso facilitado por transportadores de malato activados por Al (ALMTs). En este estudio, identificamos 15 genes en el genoma de la calabaza (Cucurbita moschata), que fueron clasificados filogenéticamente en cuatro subclades. El análisis de expresión reveló que varios ALMTs, incluyendo , , y , fueron regulados al alza en respuesta a concentraciones crecientes de Al. La aplicación exógena de poliaminas (espermidina, espermina y putrescina) alivió la inhibición del crecimiento de raíces inducida por Al, correlacionándose con una mayor secreción de malato. Notablemente, cada poliamina reguló de manera diferencial genes específicos de ALMT: la espermidina elevó la expresión de , , , y ; la espermina indujo , , , , y ; mientras que la putrescina reguló significativamente al alza , , y . Estos resultados sugieren que las poliaminas pueden mejorar la tolerancia al Al en la calabaza a través de la regulación transcripcional específica de genes de la familia ALMT y la promoción de la secreción de malato en las raíces, aunque se requiere más evidencia.