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Evaluación de complejos de melatonina-receptor alfa adrenérgico mediante análisis de acoplamiento molecular
La melatonina pineal (N-acetil-5-metoxitriptamina) es una molécula asociada de una u otra forma con prácticamente todos los sistemas fisiológicos, con el objetivo de cumplir sus funciones integradoras en la actividad del sistema nervioso central, los ciclos de sueño y vigilia, el metabolismo energético y la termorregulación, y los sistemas inmunitario, reproductivo, endocrino, cardiovascular, respiratorio y excretor. En este contexto, el presente estudio tuvo como objetivo evaluar in silico la formación de complejos entre el ligando melatonina y otras proteínas receptoras potenciales mediante análisis de acoplamiento molecular. Los principales pasos establecidos en este procedimiento experimental fueron: a) búsqueda y selección de la estructura 3D de la melatonina en DrugBank; b) búsqueda y selección de estructuras 3D de otras proteínas receptoras diana mediante STRING, protein BLAST y la base de datos PDB; y c) formación de complejos entre la melatonina y los receptores seleccionados mediante el servidor AutoDock 4.0 mediante análisis de acoplamiento molecular. Solo se identificó una alta fiabilidad y una similitud significativa entre la melatonina tipo 1B y el receptor adrenérgico alfa-2A. Por lo tanto, se realizaron ensayos de acoplamiento molecular utilizando el ligando melatonina y las estructuras cristalográficas del receptor adrenérgico alfa-2A acoplado a un antagonista (ID PDB 6kux) y un agonista parcial (ID PDB 6kuy), disponibles en la base de datos PDB. Se predijeron valores de energía de unión de -6,79 y -6,98 kcal/mol, y estabilidad estructural mediante interacciones intermoleculares no covalentes, durante la formación de complejos entre la melatonina y los receptores adrenérgicos alfa-2A 6kux y 6kuy, respectivamente. De esta manera, los hallazgos descritos en el presente estudio podrían indicar fuertes interacciones entre la melatonina y los adrenoceptores, lo que sugiere su posible efecto agonista parcial en la activación del receptor adrenérgico alfa-2A.
Autores: Borges, V. G.; Gabriel, J. E.
Idioma: Inglés
Editor: Takako Matsumura-Tundisi
Año: 2022
Artículos
Categoría
Ingeniería y Tecnología
Licencia
Atribución
Consultas: 10
Citaciones: Sin citaciones
Este documento es un artículo elaborado por Borges, V. G., y Gabriel, J. E. (Universidad Federal de San Carlos, Brasil) para Brazilian Journal of Biology Vol. 82. Publicación de Instituto Internacional de Ecología. Contacto: bjb@bjb.com.br
La melatonina pineal (N-acetil-5-metoxitriptamina) es una molécula asociada de una u otra forma con prácticamente todos los sistemas fisiológicos, con el objetivo de cumplir sus funciones integradoras en la actividad del sistema nervioso central, los ciclos de sueño y vigilia, el metabolismo energético y la termorregulación, y los sistemas inmunitario, reproductivo, endocrino, cardiovascular, respiratorio y excretor. En este contexto, el presente estudio tuvo como objetivo evaluar in silico la formación de complejos entre el ligando melatonina y otras proteínas receptoras potenciales mediante análisis de acoplamiento molecular. Los principales pasos establecidos en este procedimiento experimental fueron: a) búsqueda y selección de la estructura 3D de la melatonina en DrugBank; b) búsqueda y selección de estructuras 3D de otras proteínas receptoras diana mediante STRING, protein BLAST y la base de datos PDB; y c) formación de complejos entre la melatonina y los receptores seleccionados mediante el servidor AutoDock 4.0 mediante análisis de acoplamiento molecular. Solo se identificó una alta fiabilidad y una similitud significativa entre la melatonina tipo 1B y el receptor adrenérgico alfa-2A. Por lo tanto, se realizaron ensayos de acoplamiento molecular utilizando el ligando melatonina y las estructuras cristalográficas del receptor adrenérgico alfa-2A acoplado a un antagonista (ID PDB 6kux) y un agonista parcial (ID PDB 6kuy), disponibles en la base de datos PDB. Se predijeron valores de energía de unión de -6,79 y -6,98 kcal/mol, y estabilidad estructural mediante interacciones intermoleculares no covalentes, durante la formación de complejos entre la melatonina y los receptores adrenérgicos alfa-2A 6kux y 6kuy, respectivamente. De esta manera, los hallazgos descritos en el presente estudio podrían indicar fuertes interacciones entre la melatonina y los adrenoceptores, lo que sugiere su posible efecto agonista parcial en la activación del receptor adrenérgico alfa-2A.
Descripción
La melatonina pineal (N-acetil-5-metoxitriptamina) es una molécula asociada de una u otra forma con prácticamente todos los sistemas fisiológicos, con el objetivo de cumplir sus funciones integradoras en la actividad del sistema nervioso central, los ciclos de sueño y vigilia, el metabolismo energético y la termorregulación, y los sistemas inmunitario, reproductivo, endocrino, cardiovascular, respiratorio y excretor. En este contexto, el presente estudio tuvo como objetivo evaluar in silico la formación de complejos entre el ligando melatonina y otras proteínas receptoras potenciales mediante análisis de acoplamiento molecular. Los principales pasos establecidos en este procedimiento experimental fueron: a) búsqueda y selección de la estructura 3D de la melatonina en DrugBank; b) búsqueda y selección de estructuras 3D de otras proteínas receptoras diana mediante STRING, protein BLAST y la base de datos PDB; y c) formación de complejos entre la melatonina y los receptores seleccionados mediante el servidor AutoDock 4.0 mediante análisis de acoplamiento molecular. Solo se identificó una alta fiabilidad y una similitud significativa entre la melatonina tipo 1B y el receptor adrenérgico alfa-2A. Por lo tanto, se realizaron ensayos de acoplamiento molecular utilizando el ligando melatonina y las estructuras cristalográficas del receptor adrenérgico alfa-2A acoplado a un antagonista (ID PDB 6kux) y un agonista parcial (ID PDB 6kuy), disponibles en la base de datos PDB. Se predijeron valores de energía de unión de -6,79 y -6,98 kcal/mol, y estabilidad estructural mediante interacciones intermoleculares no covalentes, durante la formación de complejos entre la melatonina y los receptores adrenérgicos alfa-2A 6kux y 6kuy, respectivamente. De esta manera, los hallazgos descritos en el presente estudio podrían indicar fuertes interacciones entre la melatonina y los adrenoceptores, lo que sugiere su posible efecto agonista parcial en la activación del receptor adrenérgico alfa-2A.