Proponemos el método basado en rasgos para cuantificar la actividad de grupos funcionales en el microbioma intestinal humano basado en datos metatranscriptómicos. Permite evaluar cambios estructurales en la comunidad microbiana compuesta por los siguientes grupos funcionales: productores de butirato, acetógenos, reductores de sulfato y bacterias descomponedoras de mucina. Es otra forma de realizar un análisis funcional de los datos metatranscriptómicos al centrarse en el nivel ecológico de la comunidad en estudio. Para desarrollar el método, utilizamos datos publicados obtenidos en un entorno cuidadosamente controlado y de una comunidad microbiana sintética, donde el problema de ambigüedad entre funcionalidad y taxonomía está ausente. El método desarrollado fue validado utilizando datos de RNA-seq y datos de secuenciación del amplicón 16S rRNA en una comunidad simplificada. En consecuencia, la verificación exitosa proporciona perspectivas para la aplicación de este método para analizar comunidades naturales de la microbiota intestinal humana.