La evaluación de la eficiencia ecológica verde agrícola puede reflejar la capacidad de la agricultura para el desarrollo sostenible y reducir la contaminación endógena causada por los residuos agrícolas con el fin de aliviar el debilitamiento de los ecosistemas agrícolas. Tomando la economía verde agrícola como objeto de investigación, se construyó un sistema de índices de evaluación basado en las teorías de la eficiencia económica verde y el crecimiento económico para la eficiencia ecológica verde agrícola, y se exploraron empíricamente los mecanismos de impacto de indicadores específicos sobre la eficiencia ecológica verde agrícola. Además, basado en el modelo de análisis envolvente de datos (DEA), se evaluó la eficiencia ecológica verde agrícola general de China desde 2002 hasta 2021 y se analizaron las características de eficiencia desde múltiples perspectivas. Luego, se añadieron indicadores de política, finanzas, comunicación, sociedad y otros aspectos para construir un modelo de evaluación integral de la eficiencia ecológica verde agrícola utilizando una combinación de DEA y una red neuronal BP, y se verificó la viabilidad del modelo. Los resultados indican que la eficiencia ecológica verde agrícola aumentó de 0.7340 en 2002 a 0.8205 en 2021, un aumento del 11.78%. Además, la eficiencia tecnológica del sistema ecológico verde agrícola de China no mostró una tendencia de divergencia muy obvia. Los resultados de la red neuronal BP fueron consistentes con los obtenidos utilizando DEA, y la tendencia general de evolución de la red neuronal BP calculada y DEA fueron mutuamente verificadas e integradas. La efectividad y precisión de la red neuronal BP se verificó mediante una comparación con DEA.