Evaluando Métodos de Delimitación de Especies en (Trebouxiophyceae, Chlorophyta): Eficacia de los Códigos de Barras de ADN y Descripción de sp. nov. de Suelos Árticos
Autores: Krivina, Elena; Sinetova, Maria; Starikov, Alexander; Portnov, Aleksey; Temraleeva, Anna
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2025
Acceso abierto
Artículo científico
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Microalgas
Diversidad de especies
Potencial biotecnológico
Cepa VKM Al-418
Fragmento ITS1-5.8S-ITS2
Perfil de ácidos grasos
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 4
Citaciones: Sin citaciones
A pesar de la extensa investigación sobre microalgas verdes pertenecientes al género, su diversidad de especies y potencial biotecnológico siguen estando poco caracterizados. La cepa VKM Al-418, objeto de este estudio, fue aislada del suelo de Duvannyi Yar (Federación Rusa). El estatus de especie independiente de esta cepa está respaldado por características morfológicas distintas, una colocación filogenética robusta basada en el fragmento 18S-ITS1-5.8S-ITS2 y características únicas en las estructuras secundarias de ITS1 e ITS2, incluyendo un cambio de base compensatorio (CBC) en la hélice III altamente conservada de ITS2. Además, la delimitación de especies también fue confirmada utilizando cinco enfoques algorítmicos independientes que analizaron cuatro códigos de barras de ADN diferentes. El fragmento concatenado ITS1-5.8S-ITS2 es más confiable para la discriminación de especies que los códigos de barras individuales ITS1 o ITS2. De los métodos de delimitación de especies evaluados, ASAP (Assemble Species by Automatic Partitioning) y GMYC (Generalized Mixed Yule Coalescent) fueron los que mejor desempeñaron en la distinción de especies a través de múltiples regiones de códigos de barras en nuestro análisis. El perfil de ácidos grasos de la cepa VKM Al-418 fue analizado a 9 grados C, 22 grados C y 27 grados C y mostró una alta plasticidad en respuesta a la temperatura, indicativa de una estrategia adaptativa a su entorno hostil. Utilizando este enfoque taxonómico integrador, describimos sp. nov., una nueva especie con un posicionamiento filogenético distinto y propiedades biotecnológicas prometedoras.
Descripción
A pesar de la extensa investigación sobre microalgas verdes pertenecientes al género, su diversidad de especies y potencial biotecnológico siguen estando poco caracterizados. La cepa VKM Al-418, objeto de este estudio, fue aislada del suelo de Duvannyi Yar (Federación Rusa). El estatus de especie independiente de esta cepa está respaldado por características morfológicas distintas, una colocación filogenética robusta basada en el fragmento 18S-ITS1-5.8S-ITS2 y características únicas en las estructuras secundarias de ITS1 e ITS2, incluyendo un cambio de base compensatorio (CBC) en la hélice III altamente conservada de ITS2. Además, la delimitación de especies también fue confirmada utilizando cinco enfoques algorítmicos independientes que analizaron cuatro códigos de barras de ADN diferentes. El fragmento concatenado ITS1-5.8S-ITS2 es más confiable para la discriminación de especies que los códigos de barras individuales ITS1 o ITS2. De los métodos de delimitación de especies evaluados, ASAP (Assemble Species by Automatic Partitioning) y GMYC (Generalized Mixed Yule Coalescent) fueron los que mejor desempeñaron en la distinción de especies a través de múltiples regiones de códigos de barras en nuestro análisis. El perfil de ácidos grasos de la cepa VKM Al-418 fue analizado a 9 grados C, 22 grados C y 27 grados C y mostró una alta plasticidad en respuesta a la temperatura, indicativa de una estrategia adaptativa a su entorno hostil. Utilizando este enfoque taxonómico integrador, describimos sp. nov., una nueva especie con un posicionamiento filogenético distinto y propiedades biotecnológicas prometedoras.