El aceite de palma (Jacq.) se ha convertido en la principal fuente de aceite vegetal en el mundo. Se sabe que todos los genotipos existentes de esta especie están relacionados, por lo que su variabilidad genética se considera baja. En México, todas las plantaciones de palma aceitera se encuentran en el sureste del país y se establecen con semillas de diferentes orígenes, lo que ha provocado bajos rendimientos y la necesidad de establecer un programa de mejora genética. Por lo tanto, en este estudio se evaluó la extensión de la diversidad genética entre 151 accesiones de palma aceitera de todas las regiones productoras de México con veinte repeticiones simples (SSRs) y siete marcadores microsatélites amplificados al azar (RAM). Los marcadores utilizados resultaron útiles para revelar una alta variabilidad genética existente, con un total de 1218 y 708 alelos detectados y un contenido de información polimórfica (PIC) de 0.96 y 0.91 para RAM y SSR, respectivamente. La distancia genética entre todas las accesiones de palma aceitera recolectadas varió entre 31% y 82% para la similitud. Las accesiones de Tabasco y Veracruz presentaron la mayor y menor diversidad genética, respectivamente. Estos resultados pueden permitir establecer estrategias de cría para la mejora genética de este cultivo en México.