Evidencia Genómica Poblacional para la Diversificación en Diferentes Sistemas Fluviales en China
Autores: Zeng, Qianqian; Sun, Yaxian; Zhong, Hui; Yang, Conghui; Qin, Qinbo; Gu, Qianhong
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2022
Acceso abierto
Artículo científico
2022
Evidencia Genómica Poblacional para la Diversificación en Diferentes Sistemas Fluviales en ChinaCategoría
Ciencias Naturales y Subdisciplinas
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Aclarar la estructura genética puede facilitar la comprensión de la historia evolutiva de una especie. Es crucial para la gestión de los recursos de germoplasma y proporciona una guía útil para un mejor mejoramiento selectivo. es un caracol de agua dulce de importancia económica y ecológica para los peces, aves e incluso humanos. Sin embargo, las estructuras genéticas poblacionales de la especie eran desconocidas en estudios anteriores. Los enfoques de genómica poblacional con decenas a cientos de miles de polimorfismos de un solo nucleótido (SNPs) hacen posible detectar estructuras previamente no identificadas. Se llevó a cabo un estudio genómico poblacional de siete poblaciones a través de tres sistemas fluviales (Río Amarillo, Río Yangtsé y Río Perla) en China mediante SLAF-seq. SLAF-seq obtuvo un total de 4737 polimorfismos SLAF-tags y 25,999 SNPs de genoma completo de alta consistencia. La estructura genética poblacional mostró una clara división entre las poblaciones de la cuenca del Río Amarillo (YH y WL) y la cuenca del Río Perla (QSH y LB), así como la población YC de la cuenca del Río Yangtsé utilizando los datos de SNPs. Sin embargo, no existía una estructura poblacional distinta utilizando el ADN mitocondrial (mtDNA). La translocación antropogénica de la cuenca del Río Yangtsé a la cuenca del Río Perla y la dispersión pasiva de la cuenca del Río Yangtsé a la cuenca del Río Amarillo por inundaciones han debilitado el patrón filogeográfico de . La divergencia de en los tres sistemas fluviales sugiere que la dispersión antropogénica para la acuicultura y el mejoramiento requiere una seria consideración de la estructura poblacional para la preservación de la diversidad genética y la utilización efectiva de los recursos de germoplasma.
Descripción
Aclarar la estructura genética puede facilitar la comprensión de la historia evolutiva de una especie. Es crucial para la gestión de los recursos de germoplasma y proporciona una guía útil para un mejor mejoramiento selectivo. es un caracol de agua dulce de importancia económica y ecológica para los peces, aves e incluso humanos. Sin embargo, las estructuras genéticas poblacionales de la especie eran desconocidas en estudios anteriores. Los enfoques de genómica poblacional con decenas a cientos de miles de polimorfismos de un solo nucleótido (SNPs) hacen posible detectar estructuras previamente no identificadas. Se llevó a cabo un estudio genómico poblacional de siete poblaciones a través de tres sistemas fluviales (Río Amarillo, Río Yangtsé y Río Perla) en China mediante SLAF-seq. SLAF-seq obtuvo un total de 4737 polimorfismos SLAF-tags y 25,999 SNPs de genoma completo de alta consistencia. La estructura genética poblacional mostró una clara división entre las poblaciones de la cuenca del Río Amarillo (YH y WL) y la cuenca del Río Perla (QSH y LB), así como la población YC de la cuenca del Río Yangtsé utilizando los datos de SNPs. Sin embargo, no existía una estructura poblacional distinta utilizando el ADN mitocondrial (mtDNA). La translocación antropogénica de la cuenca del Río Yangtsé a la cuenca del Río Perla y la dispersión pasiva de la cuenca del Río Yangtsé a la cuenca del Río Amarillo por inundaciones han debilitado el patrón filogeográfico de . La divergencia de en los tres sistemas fluviales sugiere que la dispersión antropogénica para la acuicultura y el mejoramiento requiere una seria consideración de la estructura poblacional para la preservación de la diversidad genética y la utilización efectiva de los recursos de germoplasma.