es una planta medicinal y comestible importante en Asia y fue introducida en Europa y América del Norte principalmente como planta especiera. La especie cultivada comúnmente es un alotetraploide (AABB). Mientras que la identidad de su donante diploide AA ha sido preliminarmente aclarada, el otro donante, BB, aún no ha sido descubierto, y el estatus taxonómico y las características del donante BB siguen sin resolverse. Basado en los genomas publicados de spp., empleamos un análisis de colinealidad, evaluación de la similitud de la estructura génica y anotación funcional a múltiples niveles para inferir las características genómicas y fenotípicas del subgenoma B. Los resultados sugieren que las secuencias de proteínas de los subgenomas B y A exhiben la mayor similitud, mientras que las secuencias de proteínas de o son menos similares al subgenoma B, y los dos subgenomas también poseen el mayor número de genes homólogos y tienen estructuras génicas similares. Un total de 90 genes específicos del progenitor BB fueron significativamente enriquecidos en vías relacionadas con la biosíntesis de metabolitos secundarios y la respuesta al estrés ambiental. Entre estos genes, los genes de sintasa de terpeno constituyen la base genética principal para la diversidad de componentes bioactivos en perilla. El descubrimiento de un gen homólogo que contiene el dominio NB-ARC, asociado con la resistencia a la tizón tardía, sugiere que BB puede contribuir a rasgos clave de resistencia a enfermedades. Un análisis adicional de la familia de genes reveló que en comparación con el subgenoma A, el subgenoma B exhibió menos genes y menor diversidad en las familias y. Estos hallazgos indican que BB puede haber originado de una especie no encontrada o extinta dentro de las spp. El donante BB podría estar menos diversificado que AA, posiblemente adaptándose a un rango geográfico y climático estrecho.