Dinámicas de expresión mediadas por miR156 basadas en el transcriptoma de factores de transcripción SPL durante la transición de vegetativa a reproductiva en espinaca
Autores: Khalid, Ehsan; Zheng, Yutong; Wang, Tengqi; Cai, Lingmin; Ming, Ray
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2025
Acceso abierto
Artículo científico
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Proceso de desarrollo
MicroARN
Factores de transcripción SPL
Perfilado de expresión
Vías hormonales
Desarrollo floral
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 8
Citaciones: Sin citaciones
La transición de la fase vegetativa a la fase reproductiva es un proceso de desarrollo importante en las plantas con flores, regulado en parte por microARNs que reprimen genes objetivo post-transcripcionalmente. Sin embargo, el papel de miR156 y sus factores de transcripción de la proteína de unión al promotor Squamosa-Like (SPL) sigue siendo poco comprendido. En este estudio, identificamos 14 miembros del gen SPL en espinaca y analizamos su expresión durante la transición de fase. La identificación a nivel genómico y el análisis basado en transcriptomas revelaron que 11 de estos genes son probablemente objetivos directos de , con sitios de unión confirmados por predicción de interacción basada en secuencias. El perfil de expresión mostró que y , que están fuertemente reprimidos durante el crecimiento vegetativo, fueron significativamente regulados durante la fase de transición. Los análisis de Ontología de Genes (GO) y de elementos cis-promotores apoyan que los genes SPL están involucrados en vías hormonales y en el desarrollo floral. La Reacción en Cadena de la Polimerasa en Tiempo Real Cuantitativa (qRT-PCR) validó aún más los patrones de expresión del transcriptoma de los genes SPL clave. En conjunto, estos hallazgos delinean un marco regulador en el que se modula la actividad génica para controlar el cambio de fase de desarrollo en espinaca, destacando tanto la expansión como la diversificación funcional del gen SPL y el papel central de en la transición de vegetativa a reproductiva.
Descripción
La transición de la fase vegetativa a la fase reproductiva es un proceso de desarrollo importante en las plantas con flores, regulado en parte por microARNs que reprimen genes objetivo post-transcripcionalmente. Sin embargo, el papel de miR156 y sus factores de transcripción de la proteína de unión al promotor Squamosa-Like (SPL) sigue siendo poco comprendido. En este estudio, identificamos 14 miembros del gen SPL en espinaca y analizamos su expresión durante la transición de fase. La identificación a nivel genómico y el análisis basado en transcriptomas revelaron que 11 de estos genes son probablemente objetivos directos de , con sitios de unión confirmados por predicción de interacción basada en secuencias. El perfil de expresión mostró que y , que están fuertemente reprimidos durante el crecimiento vegetativo, fueron significativamente regulados durante la fase de transición. Los análisis de Ontología de Genes (GO) y de elementos cis-promotores apoyan que los genes SPL están involucrados en vías hormonales y en el desarrollo floral. La Reacción en Cadena de la Polimerasa en Tiempo Real Cuantitativa (qRT-PCR) validó aún más los patrones de expresión del transcriptoma de los genes SPL clave. En conjunto, estos hallazgos delinean un marco regulador en el que se modula la actividad génica para controlar el cambio de fase de desarrollo en espinaca, destacando tanto la expansión como la diversificación funcional del gen SPL y el papel central de en la transición de vegetativa a reproductiva.