Las flores son estructuras reproductivas clave para muchas especies de plantas. Son esenciales para la producción de semillas y frutos, y su desarrollo está regulado de manera estricta por redes hormonales y genéticas. Los factores de transcripción de dominio homeótico HAT3 y ATHB4 son reguladores conocidos de la identidad adaxial y la respuesta hormonal. Demostramos que las flores del mutante doble emergen en ángulos de divergencia más amplios en relación con el tipo salvaje, un fenotipo que refleja una filotaxia modificada y regulada por condiciones de baja auxina. Además, las flores exhiben un patrón aberrante de tricomas en sus sépalos asociado con una sensibilidad aumentada a la citoquinina (CK). A través del análisis de RNA-seq de inflorescencias, identificamos la desregulación de genes involucrados en la biosíntesis de auxina, el transporte de auxina y el metabolismo y transporte de CK. Estos hallazgos sugieren que HAT3 y ATHB4 ajustan finamente el equilibrio auxina/CK y coordinan eventos críticos de patrón durante el desarrollo reproductivo, ofreciendo una nueva perspectiva sobre la regulación mediada por hormonas del patrón floral.