Este estudio se llevó a cabo en los lagos Biguás y Polegar, ambos ambientes pequeños pero en diferentes etapas sucesionales. El objetivo principal fue caracterizar la comunidad de macroinvertebrados asociada a la población acuática de macrófitos en cada lago para que esta comunidad, las condiciones ambientales y la calidad del agua interactúen. Las muestras se tomaron en 2003. Se midieron las variables abióticas de los totales de N y P, la temperatura, la conductividad eléctrica, el pH y el oxígeno disuelto, así como la concentración de clorofila a. Los macroinvertebrados se muestrearon con una red de 500 µ de luz de malla, se separaron bajo un estereomicroscopio y se identificaron al nivel taxonómico más bajo posible. Sus densidades se expresaron como el número de individuos por 100 g de peso seco de macrófito. Se calcularon el índice de diversidad de Shannon-Wiener (H’), la uniformidad de Pielou (J), la frecuencia de ocurrencia, la abundancia y la riqueza de taxones para cada comunidad de invertebrados. El Lago dos Biguás se encuentra en proceso de eutrofización y, durante el estudio, presentó una gran población de Pistia stratiotes. El Lago Polegar es oligotrófico y solo presentó un pequeño banco de Nymphoides indica. Las comunidades de invertebrados asociados a macrófitos en cada lago se consideraron significativamente diferentes (p < 0,05). Se encontraron 67 taxones en el Lago dos Biguás y 32 en el Lago Polegar. En ambos lagos, la mayoría de los taxones se consideraron raros, con una baja dominancia en pocos meses. Los taxones con mayor densidad en el Lago dos Biguás fueron Chironomidae, Daphniidae y Cyclopidae, y Oligochaeta, Chironomidae y Coenagrionidae en el Lago Polegar.