Se ha realizado una investigación significativa sobre los efectos de los fertilizantes o agentes en el desarrollo sostenible de la agricultura en áreas de salinización. En contraste, se ha prestado poca atención a los efectos interactivos del fertilizante microbiano (FM) y la salinidad en las propiedades hidráulicas del suelo de salinización secundaria (SS) y del suelo salino costero (CS). Se llevó a cabo un experimento de incubación para investigar los efectos de los tipos de suelo salino, los niveles de salinidad (suelo no salino, suelo de baja salinidad y suelo de alta salinidad) y las cantidades de FM (32.89 g kg y 0 g kg) en las propiedades hidráulicas del suelo. El FM aplicado mejoró la capacidad de retención de agua del suelo en cada suelo salino en comparación con el CK, y el SS fue mayor que el CS. El FM aplicado aumentó la humedad saturada, la capacidad de campo, la humedad de fractura capilar, el coeficiente de marchitez y el coeficiente higroscópico en un 0.02-18.91% en SS, mientras que en CS se incrementó en un 11.62-181.88%. Aumentó la capacidad de suministro de agua del suelo en SS (excepto en el suelo de alta salinidad) y en CS en un 0.02-14.53% y un 0.04-2.34%, respectivamente, en comparación con el CK. El agua disponible, fácilmente disponible y no disponible en el suelo estaban correlacionadas positivamente con el FM, mientras que la gravedad del suelo y el agua fácilmente disponible y no disponible estaban correlacionadas positivamente con la salinidad en SS. Por lo tanto, se debería desarrollar un programa de fertilización potencial con FM para aumentar las propiedades hidráulicas o mitigar los efectos adversos de la salinidad en las plantas en áreas similares de SS o CS.