Los dimorfismos de tamaño sexual y poliploide son fenómenos generalizados en los peces, pero los mecanismos moleculares siguen siendo poco claros. La locha muestra tanto fenómenos de dimorfismo de crecimiento sexual como poliploide, y por lo tanto son modelos ideales para estudiar estos dos fenómenos. En este estudio, se utilizó RNA-seq por primera vez para explorar los genes expresados diferencialmente (DEGs) entre ambos sexos de lochas diploides y tetraploides en cuatro tejidos (cerebro, gonada, hígado y músculo). Los resultados mostraron que se identificaron 21,003, 17 y 1 DEGs en los tejidos de gonada, hígado y músculo, respectivamente, entre hembras y machos en ambos diploides y tetraploides. En cuanto a los niveles de ploidía, se identificaron 4956, 1496, 2187 y 1726 DEGs en los tejidos de cerebro, gonada, hígado y músculo, respectivamente, entre tetraploides y diploides del mismo sexo. Cuando se consideraron simultáneamente los dimorfismos de tamaño sexual y poliploide en los cuatro tejidos, solo se encontraron 424 DEGs en las gonadas, lo que indica que estos DEGs gonadales pueden desempeñar un importante papel regulador en la regulación de los dimorfismos de tamaño sexual y poliploide. Independientemente de la comparación de sexo o ploidía, los DEGs significativos involucrados en las vías de glucólisis/gluconeogénesis y fosforilación oxidativa se expresaron al alza en individuos de crecimiento más rápido, mientras que los genes relacionados con la biosíntesis de hormonas esteroides y la degradación y elongación de ácidos grasos se expresaron a la baja. Esto sugiere que las lochas de rápido crecimiento (tetraploides, hembras) tienen niveles más altos de metabolismo energético y menores capacidades de síntesis de hormonas esteroides y degradación de ácidos grasos que las lochas de crecimiento lento (diploides, machos). Nuestros hallazgos proporcionan un archivo para futuras investigaciones sistemáticas sobre los dimorfismos sexuales y poliploides en peces.