Análisis del transcriptoma temporal revela vías centrales y genes huérfanos que regulan la transición floral en el repollo chino
Autores: Lang, Hong; Zhang, Yuting; Zhao, Shouhe; Li, Kexin; Li, Xiaonan; Jiang, Mingliang
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2025
Acceso abierto
Artículo científico
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Transición floral
Expresión génica
Regulación hormonal
Etapas de desarrollo
Genes expresados diferencialmente
Señalización de hormonas vegetales
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 5
Citaciones: Sin citaciones
La transición floral en el repollo chino (ssp.) está gobernada por una compleja interacción de la expresión génica y la regulación hormonal. Se realizó un perfil transcriptómico temporal a través de tres etapas de desarrollo: pre-bolting (PBS), bolting (BS) y flowering stages (FS), para investigar los mecanismos moleculares subyacentes. Se identificaron un total de 7092 genes expresados diferencialmente (DEGs), que exhiben trayectorias de expresión distintas durante la transición. Además, los análisis de enriquecimiento funcional revelaron fuertes asociaciones con la señalización de hormonas vegetales, las vías MAPK y los procesos de regulación del desarrollo. Genes clave relacionados con la floración, como , , , , y mostraron patrones de expresión antagónicos. Las vías hormonales que involucran auxina, ABA, ET, BR, GA, JA, CK y SA mostraron una modulación dependiente de la etapa. Además, los genes huérfanos (OGs), especialmente (), mostraron una regulación positiva significativa durante la transición, que exhibió aumentos de 1.84 y 1.93 veces en BS y FS en comparación con PBS, respectivamente (< 0.05). La validación funcional a través de la sobreexpresión (EF1OE) promovió consistentemente la floración temprana. Los niveles de expresión de y fueron significativamente regulados al alza en las líneas EF1OE en comparación con las plantas de tipo salvaje (WT). Los hallazgos contribuyen a comprender los eventos genéticos y hormonales coordinados que impulsan el desarrollo floral en el repollo chino, sugiriendo como un candidato para la resistencia a la floración. Este trabajo también amplía el marco regulatorio existente a través de la integración exitosa de OGs en el complejo sistema de inducción floral de los cultivos.
Descripción
La transición floral en el repollo chino (ssp.) está gobernada por una compleja interacción de la expresión génica y la regulación hormonal. Se realizó un perfil transcriptómico temporal a través de tres etapas de desarrollo: pre-bolting (PBS), bolting (BS) y flowering stages (FS), para investigar los mecanismos moleculares subyacentes. Se identificaron un total de 7092 genes expresados diferencialmente (DEGs), que exhiben trayectorias de expresión distintas durante la transición. Además, los análisis de enriquecimiento funcional revelaron fuertes asociaciones con la señalización de hormonas vegetales, las vías MAPK y los procesos de regulación del desarrollo. Genes clave relacionados con la floración, como , , , , y mostraron patrones de expresión antagónicos. Las vías hormonales que involucran auxina, ABA, ET, BR, GA, JA, CK y SA mostraron una modulación dependiente de la etapa. Además, los genes huérfanos (OGs), especialmente (), mostraron una regulación positiva significativa durante la transición, que exhibió aumentos de 1.84 y 1.93 veces en BS y FS en comparación con PBS, respectivamente (< 0.05). La validación funcional a través de la sobreexpresión (EF1OE) promovió consistentemente la floración temprana. Los niveles de expresión de y fueron significativamente regulados al alza en las líneas EF1OE en comparación con las plantas de tipo salvaje (WT). Los hallazgos contribuyen a comprender los eventos genéticos y hormonales coordinados que impulsan el desarrollo floral en el repollo chino, sugiriendo como un candidato para la resistencia a la floración. Este trabajo también amplía el marco regulatorio existente a través de la integración exitosa de OGs en el complejo sistema de inducción floral de los cultivos.