Caracterización a Nivel Genómico de la Familia de Genes VDAC en Soja (L.) y Perfilado de Expresión In Silico en Respuesta al Estrés por Sequía y Salinidad
Autores: Ullah, Muhammad Muneeb; Aleem, Muqadas; Iqbal, Muhammad Mudassar; Riaz, Awais; Shi, Ainong
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2025
Acceso abierto
Artículo científico
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Soja
Proteínas VDAC
Sequía
Estrés salino
Genes
Análisis transcriptómico
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 8
Citaciones: Sin citaciones
La soja (L.) se cultiva en todo el mundo para obtener aceite comestible, alimento para ganado y biodiésel. Sin embargo, la sequía y el estrés salino se están convirtiendo en serios desafíos para el cultivo global de soja, ya que retrasan el crecimiento de las plantas de soja y causan pérdidas significativas en el rendimiento. Las proteínas de canal aniónico selectivo dependiente de voltaje (VDAC) son bien conocidas por su papel en la tolerancia a la sequía y al estrés salino en las plantas de cultivo. En este estudio, identificamos 111 genes VDAC putativos distribuidos aleatoriamente en los genomas de 14 especies de plantas, incluyendo la soja cultivada y la soja silvestre. Los estudios filogenéticos comparativos clasificaron estos genes en seis clados diferentes y encontraron las mayores similitudes estructurales entre los genes VDAC de la soja cultivada y la soja silvestre. A partir de la base de datos de dominios conservados, se encontró que porina-3 (PF01459) era el dominio conservado en todas las proteínas VDAC. Además, los estudios de anotación genética revelaron el papel de las proteínas en la actividad del canal aniónico dependiente de voltaje. También se encontró que estas proteínas interactuaban con otras proteínas, especialmente receptores mitocondriales. Se predijeron un total de 103 miARNs que podrían dirigirse a quince genes. En la soja, se encontró que estos genes estaban segmentalmente duplicados y distribuidos aleatoriamente en doce cromosomas. El análisis transcriptómico reveló que el gen mostró sobrerregulación en los nódulos radiculares, mientras que los genes 1, y mostraron sobrerregulación bajo condiciones de estrés por sequía y sal.
Descripción
La soja (L.) se cultiva en todo el mundo para obtener aceite comestible, alimento para ganado y biodiésel. Sin embargo, la sequía y el estrés salino se están convirtiendo en serios desafíos para el cultivo global de soja, ya que retrasan el crecimiento de las plantas de soja y causan pérdidas significativas en el rendimiento. Las proteínas de canal aniónico selectivo dependiente de voltaje (VDAC) son bien conocidas por su papel en la tolerancia a la sequía y al estrés salino en las plantas de cultivo. En este estudio, identificamos 111 genes VDAC putativos distribuidos aleatoriamente en los genomas de 14 especies de plantas, incluyendo la soja cultivada y la soja silvestre. Los estudios filogenéticos comparativos clasificaron estos genes en seis clados diferentes y encontraron las mayores similitudes estructurales entre los genes VDAC de la soja cultivada y la soja silvestre. A partir de la base de datos de dominios conservados, se encontró que porina-3 (PF01459) era el dominio conservado en todas las proteínas VDAC. Además, los estudios de anotación genética revelaron el papel de las proteínas en la actividad del canal aniónico dependiente de voltaje. También se encontró que estas proteínas interactuaban con otras proteínas, especialmente receptores mitocondriales. Se predijeron un total de 103 miARNs que podrían dirigirse a quince genes. En la soja, se encontró que estos genes estaban segmentalmente duplicados y distribuidos aleatoriamente en doce cromosomas. El análisis transcriptómico reveló que el gen mostró sobrerregulación en los nódulos radiculares, mientras que los genes 1, y mostraron sobrerregulación bajo condiciones de estrés por sequía y sal.