Análisis a Nivel del Genoma de la Familia de Genes en Kenaf (): Identificación, Análisis de Expresión y Respuesta al Estrés por Cadmio
Autores: Liu, Qin; Li, Shaocui; Du, Guanghui; An, Xia
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2024
Acceso abierto
Artículo científico
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Kenaf
Metales pesados
Familia de genes Nramp
Análisis filogenético
Estrés por Cd
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 3
Citaciones: Sin citaciones
El kenaf es un cultivo de fibra de basto de hierba que tiene la capacidad de tolerar y acumular metales pesados, y se ha considerado como un posible acumulador de metales pesados y planta de remediación. Nramp es un macrófago relacionado con la resistencia natural, que desempeña un papel importante en el transporte de iones metálicos divalentes, el crecimiento y desarrollo de las plantas, y el estrés abiótico. En este estudio, se analizó la familia de genes del kenaf a nivel de genoma completo. Se identificaron un total de 15 genes. Están distribuidos de manera desigual en los cromosomas. El análisis filogenético clasificó 15 proteínas HcNramp en 3 subfamilias diferentes. Todas las proteínas comparten el motivo específico 4 y el motivo 6, y los genes que pertenecen a la misma subfamilia son similares en estructura y motivo. Los promotores son ricos en elementos de respuesta hormonal, expresión de meristemos y respuesta al estrés ambiental. Bajo diferentes tratamientos, los niveles de expresión de los genes varían en diferentes tejidos, y la mayoría de ellos se expresan primero en las raíces. Estos hallazgos pueden proporcionar una base para comprender el papel potencial de la familia de genes en el kenaf en respuesta al estrés por cadmio (Cd), y son de gran importancia para la selección de genes relacionados con la tolerancia al Cd en el kenaf.
Descripción
El kenaf es un cultivo de fibra de basto de hierba que tiene la capacidad de tolerar y acumular metales pesados, y se ha considerado como un posible acumulador de metales pesados y planta de remediación. Nramp es un macrófago relacionado con la resistencia natural, que desempeña un papel importante en el transporte de iones metálicos divalentes, el crecimiento y desarrollo de las plantas, y el estrés abiótico. En este estudio, se analizó la familia de genes del kenaf a nivel de genoma completo. Se identificaron un total de 15 genes. Están distribuidos de manera desigual en los cromosomas. El análisis filogenético clasificó 15 proteínas HcNramp en 3 subfamilias diferentes. Todas las proteínas comparten el motivo específico 4 y el motivo 6, y los genes que pertenecen a la misma subfamilia son similares en estructura y motivo. Los promotores son ricos en elementos de respuesta hormonal, expresión de meristemos y respuesta al estrés ambiental. Bajo diferentes tratamientos, los niveles de expresión de los genes varían en diferentes tejidos, y la mayoría de ellos se expresan primero en las raíces. Estos hallazgos pueden proporcionar una base para comprender el papel potencial de la familia de genes en el kenaf en respuesta al estrés por cadmio (Cd), y son de gran importancia para la selección de genes relacionados con la tolerancia al Cd en el kenaf.