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Los genomas de cloroplastos comparativos de cuatro especies (Amaryllidaceae) proporcionan una nueva perspectiva sobre la relación interspecifica y la filogenia

Autores: Zhang, Fengjiao; Wang, Ning; Cheng, Guanghao; Shu, Xiaochun; Wang, Tao; Zhuang, Weibing; Lu, Ruisen; Wang, Zhong

Idioma: Inglés

Editor: MDPI

Año: 2021

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Acceso abierto

Artículo científico


Categoría

Ciencias Naturales y Subdisciplinas

Subcategoría

Biología

Palabras clave

Género
Especie
Genomas de cloroplastos
Análisis filogenético
Genes
Marco filogenómico

Licencia

CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual

Consultas: 14

Citaciones: Sin citaciones


Descripción
El género (Amaryllidaceae) consta de aproximadamente 20 especies, que son endémicas de Asia Oriental. Aunque la especie tiene una gran importancia hortícola y médica, persisten desafíos en la identificación precisa de especies debido a la frecuente hibridación natural y a la variación intraespecífica a gran escala. En este estudio, secuenciamos los genomas de cloroplastos de cuatro especies y recuperamos siete secuencias de genomas de cloroplastos (cp) publicadas en este género para análisis genómicos comparativos y filogenéticos. Se encontró que los genomas cp de estas cuatro especies recién secuenciadas tenían entre 158,405 y 158,498 pb con el mismo contenido de GC del 37.8%. La estructura de los genomas exhibió la típica estructura cuadripartita con un orden y contenido de genes conservados. Se identificaron un total de 113 genes (20 duplicados), incluidos 79 genes codificadores de proteínas (PCGs), 30 tRNAs y 4 rRNAs. El análisis filogenético mostró que las 11 especies se agruparon en tres grupos principales y se ubicaron en la base de . Se sugirió que el fue el donante femenino del , y . El y pueden derivarse de , , o . Estos resultados no solo podrían ofrecer una plataforma a escala genómica para la identificación y utilización de sino también proporcionar un marco filogenómico para futuros estudios en este género.

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