Identificación y caracterización a nivel genómico de la familia de genes en Proporciona información sobre su regulación en respuesta a tratamientos con etileno y metil jasmonato
Autores: Du, Pingping; He, Huan; Wang, Jiayin; Wang, Lili; Meng, Zhuang; Jin, Xiang; Zhang, Liyu; Wang, Fei; Li, Hongbin; Xie, Quanliang
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2024
Acceso abierto
Artículo científico
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Enzima limitante de la tasa
Vía del mevalonato
Biosíntesis de caucho
Identificación de genoma completo
HMG-CoA reductasa
Familia de genes
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 3
Citaciones: Sin citaciones
La (3-hidroxi-3-metilglutaril-CoA reductasa) juega un papel crucial como la primera enzima limitante de la velocidad en la vía del mevalonato (MVA), que es la vía ascendente de la biosíntesis de caucho natural. En este estudio, realizamos una identificación del genoma completo de (TKS), una nueva planta alternativa productora de caucho, y obtuvimos seis miembros de los genes. Se llevaron a cabo análisis bioinformáticos que incluyeron la estructura del gen, propiedades de las proteínas, localización cromosómica, relaciones evolutivas y análisis de elementos cis-actuantes. Los resultados mostraron que los genes estaban altamente conservados durante la evolución con un dominio conservado completo de HMG-CoA reductasa y estaban estrechamente relacionados con las plantas durante el proceso evolutivo. La hélice alfa es la característica más prominente de la estructura secundaria de las proteínas TkHMGR. Los análisis de colinealidad demostraron que un evento de duplicación del genoma completo (WGD) y un evento de duplicación en tándem juegan un papel clave en la expansión de esta familia y tienen más genes homólogos entre otras especies. El análisis de elementos cis-actuantes reveló que la familia de genes tenía un mayor número de elementos relacionados con MYB, sensibles a la luz y sensibles a hormonas. Además, investigamos los patrones de expresión de los miembros de la familia inducidos por etileno (ETH) y jasmonato de metilo (MeJA), y sus niveles de expresión en diferentes etapas del desarrollo de raíces. Finalmente, los resultados de localización subcelular mostraron que los seis miembros de TkHMGR estaban todos localizados en el retículo endoplásmico. En conclusión, los resultados de nuestro estudio establecen una cierta base teórica para la posterior mejora del rendimiento de caucho, la cría molecular de plantas productoras de caucho y la mejora genética de .
Descripción
La (3-hidroxi-3-metilglutaril-CoA reductasa) juega un papel crucial como la primera enzima limitante de la velocidad en la vía del mevalonato (MVA), que es la vía ascendente de la biosíntesis de caucho natural. En este estudio, realizamos una identificación del genoma completo de (TKS), una nueva planta alternativa productora de caucho, y obtuvimos seis miembros de los genes. Se llevaron a cabo análisis bioinformáticos que incluyeron la estructura del gen, propiedades de las proteínas, localización cromosómica, relaciones evolutivas y análisis de elementos cis-actuantes. Los resultados mostraron que los genes estaban altamente conservados durante la evolución con un dominio conservado completo de HMG-CoA reductasa y estaban estrechamente relacionados con las plantas durante el proceso evolutivo. La hélice alfa es la característica más prominente de la estructura secundaria de las proteínas TkHMGR. Los análisis de colinealidad demostraron que un evento de duplicación del genoma completo (WGD) y un evento de duplicación en tándem juegan un papel clave en la expansión de esta familia y tienen más genes homólogos entre otras especies. El análisis de elementos cis-actuantes reveló que la familia de genes tenía un mayor número de elementos relacionados con MYB, sensibles a la luz y sensibles a hormonas. Además, investigamos los patrones de expresión de los miembros de la familia inducidos por etileno (ETH) y jasmonato de metilo (MeJA), y sus niveles de expresión en diferentes etapas del desarrollo de raíces. Finalmente, los resultados de localización subcelular mostraron que los seis miembros de TkHMGR estaban todos localizados en el retículo endoplásmico. En conclusión, los resultados de nuestro estudio establecen una cierta base teórica para la posterior mejora del rendimiento de caucho, la cría molecular de plantas productoras de caucho y la mejora genética de .