Elucidar los mecanismos de coexistencia de especies que divergen rápidamente ha sido durante mucho tiempo un desafío en la biología evolutiva. Se espera que los loci polimórficos a nivel genómico proporcionen información sobre los procesos de especiación de estas especies estrechamente relacionadas. Este estudio se centró en siete robles esclerófilos chinos, representados por , , , , , , y , empleando 27,592 polimorfismos de un solo nucleótido para examinar sus relaciones filogenéticas a nivel genómico. Combinados con el análisis de estructura genética, los árboles filogenéticos revelaron que el agrupamiento genético de los individuos estaba influenciado tanto por la distancia geográfica como por los componentes genéticos ancestrales. Además, este estudio confirmó la existencia de relaciones evolutivas reticuladas entre las especies. El flujo genético frecuente y la introgressión dentro de las siete especies fueron principalmente responsables de los límites inter-específicos ambiguos, siendo la hibridación un motor principal de la evolución reticulada. Adicionalmente, las siete especies mostraron diferencias distintas en la ocupación de nichos. Al reconstruir la adaptabilidad climática de las unidades taxonómicas ancestrales, encontramos que la tolerancia climática de cada especie mostró respuestas diferenciales a 19 factores climáticos. En consecuencia, la diferenciación del nicho ecológico y las variaciones en la adaptación al hábitat contribuyeron a la preservación de los límites de las especies. Este estudio proporciona una comprensión integral de los procesos de especiación en géneros que divergen rápidamente y subraya la importancia de los factores genéticos y ecológicos en la formación y mantenimiento de los límites de las especies.